Salve,

da quello che descrive non vedo perchè la pillola non dovrebbe essere attiva.

La pillola del giorno dopo va presa il prima possibile dopo un rapporto sessuale per il quale la contraccezione non è stata utilizzata, ma al massimo entro 72 ore dal rapporto.
Si stima il 95% (il suo caso) di efficacia se viene presa nelle 24 ore seguenti al rapporto sessuale, 85% di efficacia tra le 24 e le 48 ore dopo il rapporto, e 58% di efficacia tra le 48 e le 72 ore successive (3 giorni).
Anche gli effetti collaterli di cui parla sono probabili:

In generale si tratta principalmente di nausea e vomito.Si possono notare anche altri effetti collaterali frequenti della pillola del giorno dopo, quali cefalea, dolori nel basso ventre, perdite di sangue (mestruazioni) o ancora delle sensazioni di tensione ai seni.

Le direi di stare tranquilla: non dovrebbero esserci  di norma cambiamenti del vostro ciclo mestruale. Tuttavia, se l’arrivo previsto per l'inizio delle vostre mestruazioni subisse un ritardo di più di 5 giorni, consulti un medico.

Cordiali saluti